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curatedTCGAData:来自癌症基因组图谱(TCGA)的经过筛选的数据作为MultiAssayExperiment对象 源码

上传者: 2021-02-17 20:45:22上传 ZIP文件 174.55KB 热度 32次
策划TCGAData 总览 curatedTCGAData是Bioconductor发行版和开发版中的实验数据包。 它利用ExperimentHub从吨他Çancerģenome甲TLAS(TCGA)作为对象MultiAssayExperiment预处理访问和策划数据。 临床治疗 来自TCGA的临床数据集包括许多变量,包括人口统计学和病理学变量。 进行了整理以合并其他一级数据和子类型信息。 删除了所有空变量,并将它们的名称保存在colData元数据中。 正在进行的工作包括合并colData不同级别的变量,从而减少某些临床变量的重复。 子类型管理 在不同的TCGA队列中(n = 33),在有详细
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