MCP05 与Mouse ENCODE配套论文相关的脚本，Pope等。 Nature 2014 “拓扑关联域是复制时间调控的稳定单位”

MCP05与Mouse ENCODE配套论文相关的脚本，Pope等。 Nature 2014“拓扑关联域是复制时间调控的稳定单位”（doi:10.1038/nature13986），这篇论文在拓扑关联域和复制时间调控方面提供了重要的见解。介绍的DefineRDBs.R脚本用于识别沿DNA复制时间数据的染色体轮廓的斜率转变，适用于任何双变量数据。

DefineRDBs.R脚本的主要功能是：

DefineRDBs( x, Slope_E = 2.75e-6, Slope_L = 1e-06, Ends = 1e6, Data_Points = 30 Length_Max = 1e6, Length_Min = 2e5, RTU_Min = 0.55, Gap, = 38e, Gap_Dis = 125e3 )

DefineRDBs识别沿DNA复制时间数据的染色体轮廓的斜率转变，但原则上可以应用于任何双变量数据。

输入参数：

x - 包含“CHR”和“POSITION”列的表格，表示数据点的基因组坐标，以及至少一列包含每个单独样本的复。

对于有兴趣深入了解的读者，可以参考以下相关资源：

1. Nature杂志 提供了许多前沿的科学研究文章，涵盖广泛的领域。

2. The Nature of Code 是一本关于编码和自然现象之间关系的书籍。

3. Nature文章 包含了许多与自然科学相关的高质量研究文章。

4. Nature_InspiredComputingandOptimization 探讨了自然启发的计算和优化技术。

5. The Fractal Geometry of Nature 这本书探讨了自然界中的分形几何。

这些资源不仅可以帮助读者更好地理解的主题，还可以扩展他们对相关领域的知识。