利用MATLAB绘制三元相图解析微生物数据

MATLAB绘制三元相图解析微生物数据

三元相图常用于微生物研究中，以等边三角形展示三个变量的比例关系。每个顶点代表一个变量，点的位置由其在三个变量中的相对比例决定。

案例：微生物OTUs在植物根系区域的富集

下图展示了细菌OTUs在植物根系不同区域（土壤、根际土壤、根组织内）的富集情况：

• 每个点代表一个OTU，其位置由其在三种环境中的相对丰度决定。
• 点的大小表示OTU的相对丰度。
• 点的颜色表示OTU显著富集的环境（黑色：土壤；红色：根际区；绿色：根内）。

通过这种方式，我们可以直观地了解每个OTU的富集区域。

绘制步骤

1. 准备数据：OTUs在三种环境中的丰度数据，以及统计检验结果（确定OTUs的富集环境）。
2. 使用MATLAB的triplot函数绘制三元相图。
3. 根据OTUs的富集环境，设置点的颜色。
4. 根据OTUs的相对丰度，设置点的大小。

总结

三元相图是一种强大的工具，可以可视化微生物数据，帮助我们理解微生物群落在不同环境中的分布和富集情况。