CAPE RNA:基于配对的RNA配对表达数据分析 开源

CAPE RNA是用于对miRNA-mRNA表达数据进行综合分析的命令行工具包。 miRNA-mRNA相互作用状态分配给每个样品独立于先验已知的实验组。 使用这些交互作用分类,可以根据与实验组相比分配的交互作用状态的分布来计算Jaccard指数,以评估预测的交互作用的质量。 此外,可以分析miRNA与mRNA表达之间的负相关性。