ConoSorter:大型锥蜗牛转录组/蛋白质组分析程序 开源

ConoSorter是一个高通量的独立程序,可实现正则表达式和配置文件隐马尔可夫模型(pHMM),以根据ER信号,前肽和成熟肽的成熟区域进行大规模鉴定,并将前体肽段分类为基因超家族和分类。原始的下一代转录组或蛋白质组数据。 ConoSorter还会生成一组相关的附加信息(蛋白质序列的频率,长度,半胱氨酸残基的数量,N末端区域的疏水率),并自动搜索ConoServer数据库,以使用户可以评估结果的可靠性和相关性,并有助于鉴定新的肽类超家族和分类。