tvscript:删除与高条件内变异相关的转录本 开源

TVscript是一种方法的实现,该方法允许从分析中删除转录本,这些分析在标准化的读取计数配置文件中显示出较高的内部条件变化。 它被设计为允许将来自不同研究的数据集合并到单个差异表达分析管道中。 该方法计算给定条件下所有样本上每个转录本的读数计数之间的成对距离,并使用这些距离内的变化以便基于从总体分布中选择的阈值来过滤转录本。 在进行差异基因表达分析之前,应将其应用于数据。 完整的细节和涉及与犬科动物驯化有关的转录组数据的案例研究可在我们提交的论文中找到(链接不久即可获得):“野性驯化:一项用于交叉研究RNA-seq分析的新方法揭示了独立​​驯化事件中涉及的常见基因” 。