NaRIBaS:基于Unix的分子模拟制备和分析工具箱 开源

基于Unix的制备和分析工具箱,用于使用bash脚本,Gromacs工具和Matlab函数在散装和平板中的纳米材料和室温离子液体。 NaRIBaS提供了一个框架,可将用户输入参数和基于终端的命令行解耦。 NaRIBaS不会替代模拟软件和特定的分析工具(例如Gromacs),但可以在更改特定的输入参数的同时重复执行任务。 该工具箱应被理解为脚本框架,而不是黑盒软件。 特定于任务的输入以及准备或分析功能,可以轻松扩展以满足不断变化的特性的科学特性。 手册中介绍了有效存储和分析大型文件以及图形化可视化和数字数据处理的概念。 一个文档化的脚本集合,可以复制作者的博士学位论文中介绍的所有模拟和分析结果。