pipeline:基因本体的声明式管道 源码

管道 这是用于Gene Ontology的声明性Jenkins管道的GitHub主页。 该管道是基因本体的“主要”管道,目前涵盖同步的ETL,QA / QC和部署职责。 可以在此处找到概述该系统及其原理的立式幻灯片集: : 。 发展 基本 管道及其相关开发均基于此存储库中的Jenkinsfile。 我们的Jenkins实例是监视新分支并在发现,更新或声明性“ cron”设置上运行它们的步骤。 在开发和运行管道之前,请与GO软件小组联系以了解有关运行,取消和资源可用性的问题。 典型的(通常是推荐的)开发流程是: 成为master一个分支 删除“ cron” 更改或删除变量:“ ZENODO_REFERENCE_CONCEPT”,“ ZENODO_ARCHIVE_CONCEPT”,“ TARGET_BUCKET”,“ AWS_CLOUDFRONT_DISTRIBUTION_ID”和