voluseg:体积细胞分割的管道 源码

体积分割管线 参考: : Mu Y *,Bennett DV *,Rubinov M *,Narayan S,Yang CT,Tanimoto M,Mensh BD,Looger LL,Ahrens MB。 胶质细胞积累的证据表明,行动是徒劳的,并且压制了不成功的行为。 Cell 2019 178:27-43。 依存关系 阿帕奇火花 先进的标准化工具(ANTs) h5py,matplotlib,nibabel,numpy> = 1.13,pandas> = 0.2,scipy,scikit-image,scikit-learn 安装 使用pip进行安装: pip install git+https://github.com/mikarubi/voluseg.git 用法示例 下载示例数据集文件夹: 使用Spark启动IPython。 导入软件包并加载默认参数。 设置和保存