使用pip或者conda安装mdtraj失败解决办法
MDTraj MDTraj是分子动力学模拟的一个python包,相对于MDAnalysis个人觉得操作性更强,更加Python范一些。其能够进行不同模拟软件的轨迹转换,常规计算,分析等等一体化。简单的说就是可以用来对轨迹进行分析,可以通过计算rmsd和rmsf值来判断轨迹的偏移等一系列操作。在2019年出的1.9.3中还包含了计算rmsf功能。所以有计算rmsf的需要的话最好还是安装1.9.3版本。 安装mdtraj需要先安装一些环境依赖numpy和cython。且版本最好更新一下,不然旧版本里可能并不包含某些必要的依赖项。 安装NumPy和Cython NumPy是Python语言的一个扩充
下载地址
用户评论
我仔细阅读了这篇文章，觉得讲解很清晰，适合初学者学习。
对于这篇文章，我给出满分，因为它帮我顺利完成了mdtraj的安装，同时还指明了一条学习路径。
抱着试试看的心态，按照这篇文章中的步骤一步一步操作，结果令人惊喜。