EZ TS:自动偶氮芳烃过渡态筛选 源码

EZ-TS 自动偶氮芳烃过渡态筛选 代码设置 将存储库克隆到您的主目录: $ git clone https://github.com/lopez-lab/EZ-TS.git 执行〜/ EZ-TS / init.sh来设置$ USER信息,本地目录,并将EZTS工具复制到〜/ bin中以便于访问: $ bash init.sh 相关软件包的安装和接口: 必须在使用前安装OpenBabel 如果从SMILES开始计算,则必须激活RDKIT环境 所有QM软件包可执行文件的路径应在主目录/home/$USER/EZ-TS/config.py中设置 用法 EZ-TS通过为每个分子生成一批过渡状态猜测结构并编写一系列计算输入/批处理文件来执行大量的预优化,构象搜索,构象异构体能量评估和最终处理,从而处理计算的设置和管理优化。 完成后,将EZ-TS发现的每个分子的最低能量跃迁状态复制到基本