vivarium bioscrape:一种接口该接口允许Vivarium使用Bioscrape软件包模拟化学React网络(CRN)并自动在CRN之间创建端口

Vivarium-Bioscrape Vivarium-bioscrape是将多尺度仿真框架Vivarium连接到化学React网络(CRN)仿真器Bioscrape的python软件包。 特别是,此程序包将生物刮擦程序包装为活体处理程序,并包括许多OneWayMap形式的派生程序,以帮助将CRN连接到彼此和其他进程。 请访问以了解如何使用Vivarium核心引擎创建计算生物学模型。 访问以了解有关bioscrape模拟器的信息,并找到bioscrape的使用示例。 安装 安装此软件包的最简单方法是通过: pip install vivarium-bioscrape (使用Python