TESSA:映射TCR曲目的功能范围 源码

泰莎 介绍 Tessa是将T细胞受体(TCR)序列分析与T细胞转录组整合的贝叶斯模型。 通过最近开发的同时提供每个T细胞的TCR序列和RNA序列的单细胞测序技术,Tessa绘制了TCR谱库的功能图谱,并产生了理解人类对疾病的免疫React的见识。 作为tessa的第一部分,在贝叶斯算法之前采用BriseisEncoder来捕获TCR序列特征并创建数值嵌入。 有关更多详细信息,请参阅我们的论文: ,Zhang,Z.,Xiong D.,Wang,X.等。 2021。 寻找更多生物信息学工具的研究人员,请访问我们的实验室网站: : 。 使用说明 tessa算法在python和R中实现。我们建议用户使用Linux shell命令执行python脚本。 依存关系 Python(版本3.6.4),R(版本3.5.1以上),Linux(x86_64-redhat-linux-gn)Shell(4