PhyloJaltoWorkflow:PhyloGWAS项目的“精简版”(https 源码

PhyloJalto工作流程 Pease等人的的“精简版”。 在工作流程,程序包和功能上进行练习。 概括 PhyloGWAS利用相关物种之间的共享方差来推断物种之间的性状进化。 分析工作流程将GWAS类型映射方法与系统发育模型相结合,以了解性状的复杂演变。 由于很少在野生种群中发现遗传变异,因此将杂交系统进化图方法应用于整个进化枝,以鉴定造成性状变异的物种间的分离变异,例如,在野生番茄进化枝中应用``PhyloGWAS'' Pease等人,是由最近的一次辐射事件引起的物种。 (2016年)确定了与果实颜色和环境变异性等性状相关的遗传变异。 此外,PhyloGWAS通过将表型性状变异映射到古代多态性的分离,从而避免了风险,在ILS进化枝中表现出优势。 这种方法可以提供必要的分析能力,以识别与紧密相关物种的性状变异相关的遗传区域。 表中的内容 大纲 在本教程中,我将使用Unix / Linux