vcfcompare:使用hap.py和nextflow比较VCF 源码

vcfcompare 使用光源和比较 如果不存在,请安装nextflow 请参阅 如果不存在则安装docker 请参阅 从Docker Hub获取hap.py Docker映像 docker pull pkrusche/hap.py:v0.3.9 singularity build hap.py_v0.3.9.img docker://pkrusche/hap.py:v0.3.9 (if prefer singularity) 取得验证码 git clone https://github.com/oxfordfun/vcfcompare 运行测试 nextflow run compare.nf -profile docker 测试默认参数(在nextflow命令行中设置自己的参数) --input tests/input (folder with vcf f