predPhogly Site 源码

predPhogly-Site 翻译后修饰(PTM)涉及生物合成过程后的共价修饰,在细胞生物学研究中起着至关重要的作用。 赖氨酸磷酸甘油酸化是一种新发现的可逆型PTM,可影响糖酵解酶的活性,并引起多种疾病,如心力衰竭,关节炎和神经系统退化。 我们的目标是通过计算表征潜在的磷酸甘油基化位点,以更准确地了解功能和因果关系。 在这项研究中,开发了一种新型的计算工具,称为predPhogly-Site,可预测蛋白质中的磷酸甘油基化位点。 它有效地利用了磷酸甘油基化位点附近氨基酸残基之间的概率序列耦合信息,并对偏斜的训练数据集进行了可变成本调整,以增强预测特征。 在10倍交叉验证和独立测试中,它具有超过0.96 MCC和0.97 AUC的准确性,达到了约99%的精度。 即使是10倍交叉验证中的标准差也几乎可以忽略不计。 此性能表明predPhogly-Site明显优于现有的预测工具,可以用作有前途