p2rank:P2Rank:基于机器学习的蛋白质 配体结合位点预测工具。 独立的命令行程序Java库用于根据蛋白质结构预测配体结合口袋 源码

P2排名 基于机器学习的配体结合位点预测。 描述 P2Rank是一个独立的命令行程序,可以从蛋白质结构预测配体结合口袋。 它无需依赖外部软件来计算复杂特征或依靠已知蛋白质-配体模板的数据库即可获得较高的预测成功率。 要求 Java 8至15 PyMOL 1.7(或更高版本)用于查看可视化效果(可选) P2Rank已在Linux,macOS和Windows上进行了测试。 在Windows上,建议使用bash控制台而不是cmd或PowerShell来执行程序。 设置 P2Rank不需要安装。 二进制包可在GitHub版本中获得。 下载: : 源代码: : 数据集: : 用法 prank predict -f test_data/1fbl.pdb # predict pockets on a single pdb file 在下面查看更多用法示例... 算法 P