第3组:组长:Ryan McMindsJesper Madsen 源码

项目名称:病毒时空 团队负责人:Ryan McMinds,Jesper Madsen 团队成员:Ann Mathew,Sofia Bhatia,Samuel Coleman,Omkar Dokur,Janelle Donglasan GVN / USF导师:Alash'le G. Abimiku博士 目标 将地理空间数据集与病毒进化速率关联 方法与实现 第一关: 下载NextStrain美国子集系统发育,包括时间尺度和分歧尺度的分支长度,以及尖端的地理位置。 估算边缘的平均地理位置。 第一个插补祖先节点作为直接后代节点/尖端之间的最短大圆弧上的一个点。 从技巧开始,然后迭代到树的根。 每个祖先的点对应于与时间尺度分支长度成比例的位置(例如,如果一个后代边缘的长度为2,而另一个后沿的长度为1,则该点是从后代1到后代2的距离的1/3。 然后将边缘的平均位置估算为祖先和后代之间的中点