Protein Lifetime Project:此python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命通过该规则蛋白质半衰期由蛋白质序列中的最后一个氨基

蛋白质终身计划 该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。 背景 90年代,亚历山大·瓦尔沙夫斯基(Alexander Varshavsky)和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是,N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物,从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此,据此,应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期,并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞中的寿命。 代码 该代码是使用Spyder版本4.2.3(是Python开发环境)使用Python3版本3.8开发的。 可以使用跨平台的Anaconda发行版下载Spyder。 Python模块 在使用此脚本之前,建议使用Anaconda Prompt安装以下Python模块: PySimpleG