bioeng project:用于乳腺癌诊断的DL模型 源码
生物工程项目/论文 基因表达 包含乳腺癌患者基因表达的数据称为brca_counts.rds ,由于python无法使用.rds文件,因此需要将其转换为.csv 。 brca <- readRDS( ' brca_counts.rds ' ) write.csv( brca , ' brca.csv ' ) Node2Vec 使用的功能网络来自 Wu,G.,Feng,X.&Stein,L.人类功能蛋白相互作用网络及其在癌症数据分析中的应用。 Genome Biol 11,R53(2010)。 Node2Vec仅允许整数作为节点,并且上面的网络文件的节点是UniProt登录号,因此必须进行转换: library( tidygraph ) library( dplyr ) network_table <- read.table( ' FIs_043009.txt ' , header
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