Genomic_Evolution:此摘要是一个收集脚本用于分析Evolution中的NGS数据 源码

Musa_NGS_Suite Musa_NGS_Suite的目的 Musa NGS Suite是一组脚本,这些脚本在不同的项目中用于使用NGS数据集分析香蕉基因组。 该套件包括两个主要部分。 第一部分从读取到SNP调用的清理开始。 此程序在Elan等人的《作物科学2020》中得到了应用。第二部分增加了额外的步骤来研究我们用于检测大的插入和缺失的染色体结构,以检查收集到的香蕉样品的遗传完整性。 依存关系 这些工具是用Perl,bash,Python3,Java开发的,并且可以在Linux系统上运行,并且需要: 工具类 网站 版 电动工具 bamtools / 2.4.0 BWA 宝马/0