eDNA_spatial_temporal_variation:Taylor ElyPaul H. Barber和Zachary Gold撰写的“调查近岸岩石礁

eDNA_spatial_temporal_variation Taylor Ely,Paul H. Barber和Zachary Gold针对“调查近岸岩石礁环境中eDNA的时空变化”的分析生成的代码,数据集和图形。去污代码由Zack Gold编写,也可以在他的页面上找到 去污: 使用修改后的gruinard_decon脚本进行净化处理,以处理2个单独的测序项目的存在。在整个净化过程中,两个项目都包括了阴性和阳性对照以及所有样品。然后,MPA项目的数据输出是单独的净化后处理。 输入输入位于数据目录中 原始Anacapa输出-fishcard_12S_all_ASV_raw_taxonomy_60_edited.txt此文件是标准的Anacapa输出社区站点表,其中包含示例列和ASV行。请参阅上面链接的Anacapa Github页面,以获取有关生物信息学处理的更详细说明。 元数据文件-