phylo seq cap:使用新型基因组测序平台的系统信息学和种群基因组学生物信息学流水线 源码

使用有针对性的序列捕获来识别杨树和柳树之间的进化关系 该存储库包含用于创建我设计的新型基因分型平台的脚本和分析笔记本,其实现在我即将发表的论文《针对柳柳科的系统发育和种群基因组学的靶向序列捕获阵列》中有所报道,。 内容 :此文件 :详细介绍Jupyter笔记本格式手稿中报告的分析的笔记本 :用于靶标捕获的探针序列,以及HybPiper用于基因序列组装的靶标参考文件 :我编写的Python脚本,用于设计序列捕获数组并分析结果数据 通过有针对性的序列捕获获得的原始阅读数据将在手稿被接受出版后在提供。