KMM:PluMA插件可运行用于宏基因组学的k Markov模型 源码

国民党 语言:C ++ 输入:TXT(输入值列表) 输出:TXT(最佳得分顺序列表) 经过测试:PluMA 1.1,GCC 4.8.4 PluMA插件运行k-Markov模型(kMM),以针对一组给定的目标序列中的每一个,在一组宏基因组学序列数据上找到最佳匹配。 插件希望输入包含三个数据的文件,每个数据都位于单独的行中: (马尔可夫模型的阶数或k值)(数据库目录,其中包含序列每个位置的一组权重文件)(FASTA格式的输入文件,带有目标序列) 输出将是一个简单的表,每个目标序列包含一行,每行包含数据库中得分最高的序列名称及其得分值。