Z chromosome_analysis_hirundo:分析家燕中Z连锁和常染色体基因组变异的工作流程 源码

燕子Z连锁基因组变异的分析 以下是有关我们对燕子种群基因组中遗传多样性和分化的分析中的数据处理和分析步骤的详细信息,重点是Z染色体和常染色体的比较,以了解控制性别相关变异的机制和Z的作用物种中的染色体。 此工作流程是Schield等人中的描述的辅助工具。 (评论中)。 以下步骤取决于以下软件,并假定依赖项位于用户路径上: conda 微动 wa GATK(v3.8-1-0和v4.0.8.1) samtools / bcftools / htslib / bgzip / tabix vcftools 床具 混合物 TWISST [R 列表和其他文件位于processing_fil