SNP_calling_GATK 源码

SNP_calling_GATK 这是运行GATK调用高质量SNP的逐步步骤,它旨在在集群上运行。 该脚本是通过实施Genome Analysis Toolkit(GATK)而构成的全基因组植物SNP调用管道的一部分。 有关GATK的更多信息,请访问: ://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us 可以在github中找到此管道的详细说明: : 作者:Taslima Haque 上次修改时间:2021年2月12日 请将您的查询发送给作者: 或 它期望什么? 这是每个脚本的示例标头,它们期望跟随变量: refDir = / work / 02786 / tasl