simoji:使用表情符号运行GROMACS模拟! 源码

Simoji-因为表情符号比您的原子名称更好 可能是偶然的,Gromacs在期望字符串的地方使用表情符号没有问题。 这意味着您可以将表情符号用作原子类型,原子名称,残基名称或分子类型,以进行更深入的模拟。 Simoji用emoji替换拓扑和结构中的所有名称,以运行此类emoji分子动力学模拟。 用法: python3 simoji.py [options] 选项: -f :输入结构(.gro) -p :输入拓扑(.top) -t :输入对应表 -o :输出结构(.gro) -op :输出拓扑(.top) -ot :输出对应表 表情符号是随机选择的,但它们在输出结构和输出拓扑之间重