HistomicsUI:用于病理图像注释和分析的Girder插件 源码

组织学UI 组织,可视化和分析组织学图像。 使用组织和管理整个幻灯片图像(WSI)文件。 它具有专用的界面,用于选择WSI,手动添加注释以及对全部或部分图像运行分析和算法。 Girder提供身份验证,访问控制和多种存储选项,包括使用本地文件系统和Amazon S2。 WSI图像通过模块读取和显示。 算法使用进行容器化,并使用 Girder插件运行。 它们可以通过和在多台工作计算机上运行。 提供了一组常用算法。 安装 Linux 在具有Python 3.6或更高版本Linux中: 先决条件: MongoDB必须已安装并正在运行。 必须安装适当版本的Python。 pip inst