ratematrix:进化速率矩阵的贝叶斯估计 源码

R包'ratematrix' Daniel S.Caetano和Luke J.Harmon 描述 R包,用于使用系统进化树研究两个或多个性状之间的进化相关性模式。 'ratematrix'提供了一套工具,用于估计进化率矩阵(R),并使用马尔可夫链蒙特卡洛方法以后验分布的形式结合不确定性。 有关此处实施的模型的种类以及它们的经验和模拟数据的更多信息,请参阅我们在系统生物学上发表的文章:“ Caetano,DS和LJHarmon。2019年。不确定性估计相关性状进化的速率。系统传记68:412–429。” 该软件包的概述可以在“ Caetano,DS,and LJ Harmon。2017.