CReVIS序列 源码

CReVIS序列 慢病毒已被广泛用作将外源DNA转移到人类细胞中以治疗各种遗传疾病的手段。 慢病毒载体从根本上整合到宿主基因组中,但它们的整合位点通常不可预测,这可能会增加其在治疗中用途的不确定性。 为了确定宿主基因组中的病毒整合位点,已经开发了几种基于PCR的方法。 但是,这种方法需要设计良好的引物组,并且准确性较差,特别是对于在克隆或大量细胞群中插入高拷贝数的病毒DNA的情况。 在这里,我们描述CReVIS-seq,这是一种使用高通量测序检测病毒插入位点的高效,全基因组方法,该方法基于体外环化和随后以CRISPR指导RNA特异性方式对基因组DNA进行切割。 由于CReVIS-seq不需要P