Image_toolbox:这是我用于钙成像数据的图像处理和下游分析的工具箱 源码

图片工具箱 最后更新:@danustc在 源代码说明 -------------------包装依赖性------------------ tifffile :由开发scikit-image :版本0.14或更高版本scikit-learn :当前为0.19.2,但是其他版本也可以使用 -------------------主要管道--------------------- Pipeline.py :数据处理的主要管道。 每次运行都会对一条鱼的数据进行预处理。 T堆栈应与FIJI中的MultiStackReg插件预先对齐。 对选定的切片执行细胞提取,合并后在整个堆栈中传播,以计算原始F值。