EnDED:EnDED是旨在检测关联网络中环境驱动的(“间接”)边缘的程序 源码

环境驱动的边缘检测程序 解析微生物关联网络中的环境影响 尽管微生物之间的生态相互作用是生态系统功能的基础,但大多数仍然未知。 高通量组学可以通过推断空间或时间上的物种相关性(可以表示为网络)来帮助揭示微生物相互作用。 这些网络中的关联可以指示物种之间的生态相互作用,或者表明相似或不同的环境偏好。 因此,重要的是要弄清这些关联并确定两个物种是否相关,因为它们在生态上相互作用,还是因为它们与非生物或生物环境因素相关。 我们开发了一种方法来确定由于环境偏好而在网络中是否存在两个物种。 我们使用四种方法(“信号模式”,“重叠”,“交互信息”和“数据处理不平等”)组合起来可以检测网络中哪些关联是环境驱动