Maslenlab_Thesis:论文代码存储库用于分析Illumina亚硫酸氢盐测序数据 源码

马斯伦实验室论文项目 作者:雅各布·古铁雷斯 目录 环境设定 读取对齐 SA1 SA2 细胞反卷积 甲基捕获歧义读富集分析 环境设定 要安装所需的conda环境以执行读取对齐,请运行bash env/conda_env_setup确保未注释创建环境的代码。 将来可以自动执行此操作。 要获取要导出到exacloud节点的环境的source env/conda_env_setup ,请source env/conda_env_setup来激活它。 读取对齐 请参阅dir mcseq_data以获取对齐管道。 JG 10/20/20:请检查是否已准备好模板文件! SA1:Illumina甲基捕