vargeno:从全基因组测序数据中快速准确地进行SNP基因分型以进行床边诊断 源码

瓦吉诺 用于全基因组测序数据和大型SNP数据库的Fase SNP基因分型工具。 从Bioconda安装 可以使用命令conda install vargeno从Bioconda conda install vargeno 。 请转到以获取有关Bioconda的更多信息。 如果您尚未 ,则可以 。 快速使用 VarGeno作为输入: FASTA文件格式的参考基因组序列。 以VCF文件格式进行基因分型的SNP列表。 以FASTQ文件格式从供体基因组测序测序。 在对个体进行基因分型之前,必须使用以下命令为参考和SNP列表构建索引: vargeno index ref.fa snp.vc