论文研究 面向多肽的分子对接算法性能对比研究.pdf

蛋白质-多肽间相互作用是计算生物学中的热门方向，对其结合的精确预测对于了解体内复杂的信号通路以及蛋白质功能，及进一步进行药物设计有着至关重要的作用。蛋白质-多肽对接方法能够有效地模拟蛋白质-多肽间相互作用，其对接性能直接决定模拟实验的准确性和成功与否。针对当前主要的蛋白质-多肽对接方法，综合测试了其算法性能；同时将本实验室开发的基于全信息粒子群算法的分子对接工具FIPSDock（Fully-Informed-Particle-Swarm-Dock）延伸到蛋白质-多肽对接领域，并评估其性能。利用标准蛋白质-多肽对接数据集（peptiDB）的21个测试例及13个定制测试例进行性能测试，主要对比分析