论文研究 成本有效发现使用池序列的同素多倍体物种的核苷酸多态性。

由于异源多倍体物种的群体遗传学研究滞后于二倍体物种，因为在分析同源杂交源于杂交亲本物种的基因拷贝方面存在实际困难。 Pool-Seq，即对合并个体进行大规模平行测序，具有检测多个群体内部和群体之间核苷酸多态性的潜力。 但是，它的使用仅限于二倍体物种。 我们通过开发生物信息流水线将Pool-Seq应用于同种多倍体物种，该流水线将读数分配给每个同系物以及每个同系物内的每个多态等位基因。 我们同时对来自24个种群的20个个体的8个基因进行了测序，并在每个同源物中发现了100多个多态性位点。 对于两个位点，我们使用读取数估算了等位基因频率，然后通过进行基于个体的估算来验证这些估算。 使用我们的生物信息