精确逼近算法 关于互补最大条带恢复问题
基因序列匹配,近似最优算法给定两个基因组图G1和G2,每个表示为N序列。
基因标记,最大条带恢复(MSR)问题是保持最大值。
G1和G2中标记的数量,使得所得到的子序列,表示
作为G*
一
G·*
2,可以分割成相同长度的最大子串集。
大于或等于二。这样的子串可以发生在反转和否定中。
形式。互补最大条带恢复(CMSR)问题是删除
从G1和G2的最小数量的标记用于相同的目的,用它的
基因总最大化的优化目标精确互补
保留在最终最大子串中的标记。MSR和CMSR都是
显示NP-硬和APX硬。MSR的一个4近似算法是已知的。
问题,但没有恒定比近似算法CMSR。在本文中,我们
提出了一种
下载地址
用户评论